Фамилия Меруха — редкая, и её происхождение неочевидно. В ней нет типичного русского фамильного суффикса (-ов, -ин, -ский), что сразу наводит на мысль о нестандартной основе. Скорее всего, перед нами фамилия, образованная от прозвища или географического названия, а не от крестильного имени.

Самая вероятная версия связывает фамилию с украинским или белорусским диалектным словом «меруха» — так в некоторых регионах называли можжевельник. В этом случае прозвище Меруха мог получить человек, живший в зарослях можжевельника, либо занимавшийся сбором его ягод (их использовали в народной медицине и как пряность). Фамилии, образованные от названий растений, без дополнительного суффикса, характерны для западнорусских и украинских земель: ср. Калина, Сосна, Верба. В пользу этой версии говорит и то, что окончание -а в основе указывает на форму женского рода в украинской или белорусской традиции прозвищ.

Менее распространённая гипотеза выводит фамилию из ивритского имени Меруха (вариант Мерухам), что значит «возлюбленный» или «желанный». Такая версия возможна, если носители фамилии имеют еврейские корни, но в русском контексте она менее вероятна: фамилии на -а от библейских имён в еврейской среде обычно оформлялись суффиксами -ович, -ский или -зон.

Встречаемость фамилии Меруха крайне низкая. По открытым данным, основная масса носителей сосредоточена на западе России и в восточных областях Украины. Это косвенно подтверждает диалектную, а не библейскую версию происхождения. Социальный статус предков, скорее всего, был крестьянским или казачьим — прозвища от растений и местных реалий давали в среде, близкой к земле и лесу. Фамилия не получила широкого распространения и не попала в дворянские родословные книги, что делает её типичным примером «народной» фамилии, сохранившейся в одном-двух локальных гнёздах.