Фамилия Мигаеси — редкий случай, когда основа явно указывает на глагол, но сам глагол в современном русском языке почти не употребляется. Разберём её по косточкам.

В основе лежит корень «мига-», тот же, что в словах «мигать», «мигнуть». Но если бы фамилия образовалась от распространённого глагола, она звучала бы как Мигаев (от Мигай) или Мигалин (от Мигала). Здесь же мы видим суффикс «-еси», который в русской ономастике — редкость. Скорее всего, это усечённая форма от полного имени или прозвища, например, Мигаесий. В старину такие имена давали по действию: «Мигаесий» мог означать «тот, кто мигает», «быстрый взглядом» или, возможно, «подмигивающий» — прозвище, данное за привычку или особенность поведения.

Вероятнее всего, фамилия имеет украинское или белорусское происхождение. Суффикс «-еси» характерен для западнорусских говоров и украинского языка, где встречаются фамилии вроде Мигалеси, Миганеси. В России подобная модель почти не встречается, поэтому географически предки носителя фамилии Мигаеси, скорее всего, жили на территории современной Украины или Беларуси, возможно, в Черниговской или Гродненской губерниях.

Словообразовательный аналог — фамилии на «-еси» от других глаголов: Дремеси (от дремать), Кивеси (от кивать). Все они крайне редки и указывают на то, что прозвище было образовано не от полного глагола, а от его краткой, почти междометной формы. Мигаеси — не «мигающий», а скорее «мигай-еси», то есть «ты мигаешь» или «мигающий ты». Такая конструкция могла закрепиться как уличное прозвище, а затем перейти в фамилию.

Сословная принадлежность предков неясна. Фамилии с такой нестандартной моделью обычно возникали в крестьянской или казачьей среде, где прозвища давали по внешним признакам и поведению, а не по профессии. Дворянских родов с фамилией Мигаеси в российских родословных книгах не зафиксировано.