Фамилия Микелионис — редкий для России пример литовской антропонимии, проникшей на восток. Её сразу выдает суффикс -онис, который в литовском языке работает как отчество или фамильный патроним: он указывает на происхождение от отца или предка. Если русский скажет «Михайлов» (сын Михаила), то литовец — «Микелионис» (сын Микелиса). Основа здесь — личное имя Микелис, литовский аналог греческого Михаил, которое переводится как «кто как Бог». То есть фамилия буквально означает «сын Микелиса» или «потомок Микелиса».

Такие фамилии на -онис массово закрепились в Литве в XIX веке, когда шло оформление фамилий у крестьян после отмены крепостного права. Однако носители Микелионис могли оказаться в России и по другой причине. В советское время литовцы переезжали в другие республики, а в XIX — начале XX века многие литовские крестьяне переселялись в Сибирь и на Дальний Восток в поисках земли. Поэтому встретить Микелионис можно не только в Калининградской области или Литве, но и, скажем, в Иркутской области или Красноярском крае.

Ударение в фамилии, скорее всего, падает на второй слог: Мике́лионис. Это соответствует литовской норме, где ударение подвижное, но в фамилиях часто фиксируется на корне. Вариант с ударением на последний слог (Микелио́нис) возможен, но он уже результат обрусения или ошибки при записи.

С точки зрения социальной истории, фамилия Микелионис — крестьянская, без дворянских корней. Литовские бояре и шляхтичи обычно имели фамилии на -и́с, -а́с или -у́с, а также польские формы на -ский. Суффикс -онис — признак простого происхождения. Правда, один из самых известных носителей — советский и литовский биолог, академик Витаутас Микелионис (работал в области генетики и селекции), — своей научной карьерой эту сословную границу давно перешагнул.