Фамилия Микелая — редкий случай в русском ономастиконе. Сразу бросается в глаза окончание «-ая», типичное для русских фамилий, но основа «Микел-» указывает на нерусское происхождение. Скорее всего, перед нами пример того, как фамилия, принесённая из другой языковой среды, адаптировалась под русские грамматические формы.

Самая вероятная версия связывает Микелая с грузинской фамилией Микеладзе. В Грузии фамилии на «-дзе» (сын) и «-швили» (дитя) широко распространены. При переезде в русскоязычную среду окончание могли изменить или упростить до более привычного «-ая» по аналогии с русскими фамилиями типа «Глинка» или «Сорока». Основа «Микел-» восходит к имени Михаил в грузинском произношении (Микел). Таким образом, Микелая — это «Михайлов» по-грузински, то есть потомок человека по имени Микел (Михаил).

Менее убедительной выглядит версия о происхождении непосредственно от русского имени Михаил с помощью суффикса «-ая». В русской традиции фамилии на «-ая» чаще встречаются в форме прилагательных (Толстая, Красная) или от прозвищ. Фамилия Микелая не вписывается в эту модель, и грузинский след здесь кажется более логичным.

Географически фамилия Микелая встречается в России нечасто, но заметна в регионах, куда традиционно приезжали выходцы из Закавказья — Краснодарский край, Ростовская область, Москва. Это косвенно подтверждает версию о миграции и адаптации фамилии.

Социально носители фамилии Микелая в большинстве своём, вероятно, потомки грузин, переселившихся в Россию в XIX–XX веках. Среди них могли быть как крестьяне, так и представители духовенства или купечества, но точных данных о сословной принадлежности предков нет.