Фамилия Михальчено образована по одной из самых распространённых в украинской ономастике моделей — с суффиксом -енко. Этот суффикс, буквально означавший «маленький» или «сын», в XV–XVII веках закрепился на Левобережной и Слободской Украине как главный способ обозначения потомка по отцу. Михальчено — буквально «сын Михаля». Исходная форма Михаль — это просторечный, диалектный вариант имени Михаил, распространённый в украинских и белорусских говорах. Как и многие фамилии на -енко, Михальчено изначально было не наследственным родовым именем, а отчеством: в реестрах казацкой старшины или переписных книгах XVII века человек мог значиться как «Иван, Михалёв сын», что со временем и превратилось в фамилию.

Интересная деталь, отличающая эту фамилию от однокоренных (например, Михальченко или Михальчук), — написание через -о в конце. В украинском языке суффикс -енко произносится с чётким ударным [о], но в русской передаче часто пишется через -о, что создаёт иллюзию «обрусевшей» формы. На самом деле Михальчено — это та же самая украинская фамилия, но зафиксированная в документах именно в таком фонетическом варианте. Это типично для переселенцев из Малороссии в центральные губернии Российской империи, где писарь записывал фамилию на слух, не меняя окончания.

Основа фамилии — Михаль — имеет свою историю. Имя Михаил в народной среде часто сокращали и смягчали: Михаль, Михалько, Миша. В отличие от литературного «Михайло», форма «Михаль» характерна для западных и юго-западных регионов (Волынь, Подолье, Галичина). Соответственно, носители фамилии Михальчено, скорее всего, ведут происхождение из этих земель, откуда их предки могли мигрировать на восток. Род занятий предка, как и в большинстве фамилий на -енко, не зашифрован в основе: это просто имя отца, а не прозвище по профессии. Исключение — если Михаль было не именем, а прозвищем, но это маловероятно: прозвищная форма «Михаль» фиксируется в источниках исключительно как вариант канонического имени.

В сословном плане фамилия Михальчено не указывает на дворянство или крепостное состояние — она могла принадлежать и казаку, и крестьянину, и мещанину. Надёжных данных о массовом распространении фамилии в конкретных губерниях нет, но по косвенным признакам (фонетика и суффикс) её ареал — центральная и восточная Украина, а также приграничные области России (Курская, Воронежская, Ростовская), куда активно переселялись украинские крестьяне в XVIII–XIX веках.