Фамилия Микушова — женская форма, а её мужской вариант — Микушов. В основе лежит имя Микуш, которое в славянской традиции является уменьшительной или обиходной формой сразу нескольких крестильных имён. Чаще всего — от Николай (через народное Микула, Микола), реже — от Михаил или Дмитрий. Такая множественная «расшифровка» типична для имён, которые в быту сильно сокращались и видоизменялись. В чешском и словацком ареале Микуш — самостоятельное имя, аналог русского Миша или Коля, но в русских говорах оно тоже встречалось, особенно в западных и южных областях.

Фамилия образована по самой распространённой восточнославянской модели: к основе Микуш добавили суффикс -ов (в женском роде -ова). Это указание на принадлежность: «Микушов» означало «сын Микуша» или «из семьи Микуша». Если бы фамилия возникла от прозвища, а не от имени, то Микушем могли назвать человека маленького роста или с какими-то чертами, напоминающими «микулу» — в некоторых диалектах так называли невысокого, коренастого мужчину. Но это менее вероятно: имя-основа встречается гораздо чаще.

Интересная деталь: фамилия Микушов (и Микушова) распространена не только в России, но и в Беларуси, особенно в Могилёвской и Витебской областях, а также в польском приграничье. В польском языке суффикс -ов/-ев нехарактерен, там была бы форма Микуш, но русская и белорусская фамилия «приросла» суффиксом именно по восточнославянскому образцу. Это указывает на то, что предки носителей фамилии жили на территории, где пересекались польское, белорусское и русское влияние — скорее всего, в Смоленщине, Брянщине или на востоке современной Беларуси.

Социальный состав носителей, скорее всего, был крестьянским или мещанским. Фамилии на -ов от полных и уменьшительных имён в XVI–XVII веках получали в первую очередь простые люди, а не дворяне. Дворянские фамилии чаще имели суффиксы -ский/-цкий или образовывались от географических названий. Так что Микушовы — потомки обычных работников, ремесленников или крестьян, чей предок носил обиходное имя Микуш.

Однокоренные фамилии — Микулин, Микулов, Микушев, Микушин. Все они восходят к тому же корню, но различаются суффиксами: -ин указывает на принадлежность к матери (от Микуши — жены или дочери Микуша), а -ев — вариант того же -ов после мягкой основы. Микушова стоит в этом ряду как одна из самых прозрачных форм: сразу видно исходное имя без дополнительных переогласовок.