Фамилия Микушин образована от имени Микуша – южнославянского аналога имени Николай. Имя Николай восходит к греческому Nikolaos, где nika означает «побеждать», а laos – «народ». Таким образом, потомок человека, обладающего именем Микуша, со временем получил фамилию Микушин.