Фамилия Микушин — это отчество, которое образовалось от обиходной формы крестильного имени. В основе лежит имя Микуша, уменьшительная форма, которую на Руси использовали как просторечный вариант церковного имени Николай. Само имя Николай восходит к древнегреческому Nikolaos, где nika означает «побеждать», а laos — «народ», то есть «победитель народов». Однако напрямую от полного церковного имени фамилию не произвели: в народной среде прижился более короткий и удобный вариант Микуша, который и стал основой для фамилии.

Словообразовательная модель здесь классическая для русских фамилий: к основе на -а добавили притяжательный суффикс -ин, который указывал на принадлежность. Первоначально Микушин означало «чей-то сын» или «чей-то человек», то есть «сын Микуши». Такой тип фамилий массово складывался в XV–XVII веках, когда отчества постепенно закреплялись и передавались по наследству. Интересно, что имя Микуша встречается не только в северорусских землях, но и у южных славян, где оно также служило аналогом Николая. Это говорит о том, что фамилия могла возникнуть в разных регионах независимо, но с одним и тем же смыслом.

Примечательно, что от той же основы образовались и другие фамилии: Микулин, Микулич, Микулович. Все они — родственники по корню, но суффиксы разводят их по разным традициям. Микушин с суффиксом -ин типичен для центральной России и Поволжья, тогда как Микулин чаще встречается в западных областях. Если сравнивать с однокоренными вариантами, Микушин выглядит наиболее «великорусским» по форме.

Точное время и место возникновения фамилии установить сложно: процесс формирования фамилий у разных сословий растянулся на столетия, а письменные источники фиксируют лишь поздние этапы. Можно лишь уверенно сказать, что предки носителей фамилии носили имя Микуша, которое в быту заменяло громоздкое Николай. Сама фамилия — живой след того, как церковные имена перекраивались народным языком и превращались в устойчивые родовые прозвания.