Фамилия Минбагисов — редкая и сложносоставная, в которой переплелись тюркские и, возможно, арабские корни. Её основа — мужское имя или прозвище Минбагис, которое на русской почве получило стандартный патронимический суффикс -ов, означающий «сын такого-то» или «принадлежащий ему». Таким образом, Минбагисов — это «потомок Минбагиса».

Разберём имя-основу. Первая часть, «мин», в тюркских языках (татарском, башкирском) означает «тысяча» или «родинка». Значение «тысяча» часто входило в состав имён как пожелание множества потомков или как часть воинского титула (например, «минбаши» — тысяцкий). Вторая часть, «багис», скорее всего, восходит к арабскому слову «баги́с» (باعث) — «побудитель», «воскреситель» или «посланник». В исламской традиции это один из эпитетов пророка Мухаммеда, а также нередкая часть имён, означающая «побуждающий к добру».

Самый правдоподобный вариант: имя Минбагис — это пожелательное имя-композит, которое можно перевести как «тысяча побудителей» или «тысяча (множество) посланников». Однако есть и бытовая версия: если «мин» — это «родинка», то прозвище могло означать «человек с родинкой (по имени) Багис», но она менее вероятна, поскольку «багис» как самостоятельное имя встречается редко.

Фамилия Минбагисов — яркий маркер тюрко-мусульманского происхождения, скорее всего, татарского или башкирского. Её носители, вероятно, жили в Волго-Уральском регионе или в среде татарских переселенцев. Суффикс -ов, а не -ин, указывает на то, что фамилия оформилась уже в русскоязычной среде, после крещения или при переписях, когда инородные имена адаптировали под имперские стандарты.

Поскольку фамилия встречается редко, её носители, скорее всего, принадлежали к одному роду или нескольким близким семьям. Сословно это могли быть государственные крестьяне, служилые татары или купцы — точных данных нет, но составное имя с «мин» чаще давали людям не из самых низов, желая им многочисленного потомства или воинской удачи.