Фамилия Миннегараева — женская форма мужской фамилии Миннегараев. Тот редкий случай, когда основа фамилии не славянская, а тюркско-мусульманская, что сразу указывает на происхождение носителей из народов Поволжья и Приуралья: татар, башкир или, реже, казахов. Фамилия образована по русской модели (суффикс -ев, указывающий на принадлежность), но корень её — арабское имя, пришедшее через исламскую традицию.

Разбираем основу «Миннегара». Она состоит из двух частей: «минне» и «гара». Первая часть восходит к арабскому слову «мин» (مِن) — «из, от», но в татарских составных именах оно чаще трансформируется в «минне» со значением «родинка» (родинка на теле считалась особым знаком). Вторая часть — «гара» — это искажённое арабское «гара» (غرة) — «начало, почёт, слава», либо «гара» (гара) — «пещера, укрытие». Однако в ономастике наиболее вероятное толкование — «гара» как вариант «гариф» (знающий, сведущий). Таким образом, Миннегара — это сложное имя, которое можно перевести как «родинка, отмеченная славой» или «знак почёта».

Модель образования фамилии проста: к полному имени Миннегара добавили русский патронимический суффикс -ев (сын Миннегары) и окончание -а для женского рода. В татарской среде такие фамилии начали массово закрепляться после переписи 1897 года, когда крестьянам и горожанам давали фамилии по отцу. До этого носители пользовались только именем и отчеством (Миннегара улы — сын Миннегары).

Географически фамилия Миннегараева распространена в Татарстане, Башкортостане, Оренбургской и Челябинской областях. Встречаются варианты написания: Миннегаряева (с мягким знаком) или Миннегарева (с утратой одной «а»), но исходная форма — с двумя «а» в середине — более архаична и близка к имени-основе.

Однокоренные фамилии — Миннегалиев, Миннебаев, Миннегулов — показывают, что «минне» в первой части было продуктивным компонентом. Интересно, что фамилия не перешла в дворянские роды: носители были преимущественно крестьянами и мещанами, а в советское время — рабочими и служащими. Известных исторических личностей с этой фамилией нет, что типично для фамилий, возникших в среде простого народа.