Фамилия Минуенко звучит на украинский лад, но корни у неё, скорее всего, общие с русскими фамилиями вроде Минин или Минаев. Разобраться с её происхождением мешает двойственность основы: она могла возникнуть и от церковного имени, и от живого прозвища.

Самая вероятная версия ведёт к каноническому мужскому имени Мина (в церковной форме — Миней). Это имя греческого происхождения, восходит к слову «мэн» — «месяц». В прошлом оно было популярным: в святцах Мина упоминается десять раз, а его носил, например, преподобный мученик Мина, образованный и красноречивый афинянин, тайно исповедовавший веру Христову. В народной среде полное имя быстро превратилось в просторечную форму Минуй — по аналогии с другими именами, которые «обрусели» окончанием -уй (как Андрей — Андрюй или Тимофей — Тимохуй). От этой формы и пошла фамилия: суффикс -енко в украинской традиции означает «сын» или «потомок», то есть Минуенко — буквально «сын Минуя». Сегодня имя Мина вышло из употребления, как почти все мужские имена с окончанием на -а, но память о нём сохранилась в фамилиях.

Есть и вторая версия, менее очевидная, но с живой почвой. В русских говорах Поволжья и Урала записан глагол «минать» — «мять». От него могло возникнуть прозвище Минуй для человека, который, скажем, мял лён или кожу, либо для того, кто отличался крепкой хваткой. В этом случае фамилия Минуенко — не по имени, а по ремеслу или характеру предка. Однако эта гипотеза слабее: прозвищная основа встречается реже, чем имя, которое было в святцах, а потому первая версия выглядит правдоподобнее.

Суффикс -енко надёжно указывает на территорию формирования фамилии — это украинские земли, где такие фамилии массово закрепились в XVI–XVII веках. В России фамилия Минуенко встречается заметно реже, и её носители, как правило, имеют корни с Украины или из южнорусских областей, граничивших с ней. Забавная деталь: если бы фамилия формировалась в великорусских говорах, от того же имени Мина скорее получилось бы Минин или Минаев, а форма с -енко выдаёт именно украинскую модель.

Известных исторических носителей фамилии Минуенко мы не находим — она не попадает в старинные боярские или дворянские списки. Это типичная крестьянская или казацкая фамилия, которая закрепилась в документах поздно, уже в XVIII–XIX веках, когда фамилии стали обязательными для податных сословий. Так что предки современных Минуенко, скорее всего, были простыми людьми — землепашцами, ремесленниками или казаками, и их фамилия либо хранит память о древнем имени, либо о прозвище, связанном с работой руками.