Фамилия Мануенко звучит как типичная украинская фамилия, и это первое, что бросается в глаза. Её выдает суффикс -енко, который в украинской ономастике означает «сын» или «потомок». Если разобрать слово по косточкам, в основе лежит имя Мануйло (или Мануил) — народная форма канонического имени Мануил. Это имя греческого происхождения, от Эммануил, что значит «с нами Бог». То есть Мануенко — буквально «сын Мануйла».

Однако здесь есть нюанс, который делает фамилию не совсем шаблонной. В украинском языке при добавлении суффикса -енко к основе на -ил или -ило обычно происходит стяжение: Мануйл-о + енко = Мануйленко. Мы же видим форму Мануенко, где звук [й] выпал. Это не ошибка, а живой диалектный или разговорный процесс: язык стремится к упрощению произношения. В старых метрических книгах можно встретить оба варианта — и Мануйленко, и Мануенко. Второй со временем закрепился как самостоятельная фамилия.

Географически фамилия тяготеет к центральным и восточным областям Украины — Полтавщине, Черкащине, Сумщине. Это регионы, где в XVIII–XIX веках активно формировался малороссийский казачий и крестьянский ономастикон. Сословно Мануенко — почти наверняка потомки свободных поселян или казаков. Дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано, а значит, предки были людьми «тяглыми» — пахали землю или несли службу на границе.

Любопытно, что в русском языке существует параллельная форма Мануйлов, образованная по великорусской модели (суффикс -ов). Разница в суффиксе как раз и указывает на разную историю: Мануйловы — это выходцы из северных земель, где было принято говорить «чей?» — «Иванов», а Мануенко — южная, украинская ветвь, где говорили «чий син?» — «Іваненко». Так по одной фамилии можно проследить, с какой стороны Днепра жил родоначальник.