Фамилия Мишулкина — женская форма, мужской вариант Мишулкин. По модели образования это типичная «фамилия-притяжательное»: суффикс -ин указывает на принадлежность кому-то, в данном случае человеку по имени или прозвищу Мишулка. Основа здесь — уменьшительно-ласкательная форма от имени Михаил, которое в народной русской традиции давало множество производных: Миша, Мишутка, Мишуня, Мишура и, в том числе, Мишулка.

Имя Михаил пришло на Русь с христианством из древнееврейского (означает «кто как Бог»), но в повседневном обиходе быстро обросло простонародными вариантами. Форма Мишулка — неофициальная, домашняя. Так могли называть младшего сына, любимого внука или просто человека небольшого роста или с мягким характером. В некоторых говорах «мишулкой» могли прозвать и того, кто чем-то напоминал медведя (Михайло Потапыч — тоже от Михаила), но это уже вторичное, народно-ассоциативное значение.

Географически фамилия Мишулкин встречается в центральных и северных областях России — там, где имя Михаил было особенно популярно, а уменьшительные формы активно переходили в фамилии. В документах XVII–XVIII веков крестьяне и посадские люди с таким именем фиксировались как Мишулка Иванов сын — откуда и пошла фамилия.

В отличие, скажем, от фамилии Мишин (тоже от Михаила, но через более короткую форму «Миша»), Мишулкин сохранила редкий суффикс -улк-, который в русской антропонимии встречается нечасто. Он придаёт фамилии оттенок особой ласковости или даже некоторой уменьшительности — предок, скорее всего, был младшим в семье или отличался невысоким ростом.

Таким образом, Мишулкина — фамилия, напрямую отсылающая к имени Михаил через народную уменьшительную форму. Никакого тайного смысла или профессионального корня здесь нет: это чисто семейное, «домашнее» прозвище, закрепившееся в официальном родовом имени.