Фамилия Мисиков образована от прозвища Миса. Оно, по одной из версий, ведет свое начало от аналогичного украинского нарицательного со значением «большая тарелка». Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Миса, со временем получил фамилию Мисиков.