Фамилия Мисиков образована от прозвища Миса, и это самый вероятный путь её появления. В основе лежит украинское нарицательное слово «миса» — так называют большую тарелку, миску. Прозвище могло закрепиться за человеком по разным бытовым причинам: либо за любовь к сытной еде, либо за его занятие — например, за изготовление или продажу такой посуды. Впрочем, точный повод для прозвища сейчас уже не восстановить.

Словообразовательная модель здесь простая и прозрачная. К основе Миса добавили суффикс -ик, который в славянской традиции часто указывал на принадлежность или связь: Мисик — это «сын Миси» или «человек, имеющий отношение к Мисе». Затем фамильный суффикс -ов закрепил эту форму как родовое имя. Такой путь — от прозвища через патроним к фамилии — один из самых распространённых в восточнославянской ономастике, и Мисиков следует именно этой типовой модели.

Интересно, что суффикс -ик в данной фамилии отличает её от более частых образований на -ин или -ов напрямую от основы. Форма Мисиков буквально означает «внук или потомок Мисика», то есть в цепочке поколений было минимум два звена: сначала Миса, затем его сын Мисик, и только потом закрепилась фамилия. Это делает фамилию чуть более «молодой» по сравнению с теми, что образованы сразу от личного имени или прозвища.

Сам корень «мис-» в украинском языке родственен русскому слову «миска». В древнерусском и украинском быту миска была предметом первой необходимости, поэтому прозвища от названий посуды встречались нередко. Сравните с фамилиями типа Мискин или Мищенко — они тоже восходят к той же смысловой области, хотя и образованы по другим моделям. Редкость формы Мисиков, вероятно, объясняется локальным бытованием прозвища в определённых говорах, где слово «миса» было особенно употребительным.

Географически фамилия тяготеет к южнорусским и украинским землям, что согласуется с украинским происхождением основы. Однако со временем носители могли расселиться шире, и сейчас фамилию можно встретить в разных регионах. Точных данных о сословной принадлежности первых Мисиковых нет — прозвищные фамилии такого типа встречались и среди крестьян, и среди казаков, и среди посадских людей.

Отдельно стоит сказать, что версия о происхождении от личного имени Миса, которое могло быть краткой формой от Михаил или Моисей, выглядит менее убедительной. Для таких имён более характерны суффиксы -ин или -ов напрямую (Мисин, Михайлов), а промежуточное звено с -ик указывает именно на прозвищную, нарицательную основу. Поэтому основная версия — от слова «миса» — остаётся наиболее правдоподобной.