Фамилия Миски — редкий случай, когда форма множественного числа (или родительного падежа) застыла в качестве родового имени. В русской ономастике фамилии на -и, -ы (Миски, Мордвины, Глухие) обычно указывают на коллективное прозвище целой семьи или на происхождение от главы дома, которого звали в обиходе «Миска». То есть предка могли называть не по имени-отчеству, а по его собственному прозвищу Миска, а всю его семью — «Миски», «чьи вы?» — «Мискины».

Само слово «миска» в древнерусском языке означало не только посуду для еды, но и нечто округлое, полое. Прозвище Миска могли дать человеку с круглым лицом, небольшому и плотному, либо тому, кто постоянно носил с собой миску — например, нищему или страннику. Однако не исключено, что прозвище было ироничным: так могли прозвать того, кто любил поесть или, наоборот, был очень худым (по контрасту с «полной» миской). В словаре русских прозвищ такие случаи встречаются, хотя и не массово.

Словообразовательная модель здесь нестандартна. Обычно русские фамилии образуются через суффиксы принадлежности (-ов, -ев, -ин): Мискин, Мисков. Но форма Миски — это либо застывшая форма родительного падежа единственного числа («из дома Миски»), либо именительный падеж множественного числа, характерный для северных и сибирских говоров. В некоторых регионах (Архангельская, Вологодская области) фамилии в такой форме встречаются чаще, чем в центральной России.

Географически фамилия Миски не привязана к одной области, но встречается точечно. В дореволюционных переписях её можно найти среди крестьян и мещан, реже — среди казаков. Интересно, что в украинском и белорусском языках слово «миска» тоже распространено, но фамилия Миски там чаще записывается как Міскі (с мягким знаком) или через суффикс -енко. Русский вариант, скорее всего, возник именно на северо-западе или в Поволжье, где форма на -и была продуктивной.

Спорных версий немного. Иногда Миски ошибочно связывают с тюркским корнем «миск» (мелкая монета, чешуя), но это натяжка — прозвище от названия посуды гораздо естественнее для русского быта. Также не стоит путать фамилию с топонимом Миски (например, село в Пензенской области): фамилия могла возникнуть и от названия населённого пункта, если предки переселились оттуда, но это менее вероятно, так как прозвищная основа очевиднее.

В целом, носитель фамилии Миски может с высокой вероятностью считать, что его предок получил прозвище по внешности или привычке, связанной с миской, а сама фамилия закрепилась в форме, характерной для русского Севера.