Фамилия Мискичеков — редкая и структурно необычная. Она сразу привлекает внимание суффиксом -еков, который встречается гораздо реже, чем стандартные -ов или -ев. В русской антропонимии суффикс -еков часто появляется в результате фонетических изменений: основа на -ек (или -ка) плюс притяжательный суффикс -ов даёт форму Мискичеков. Если бы исходное прозвище звучало как Мискич, фамилия была бы Мискичев. Но здесь мы видим Мискичек — уменьшительную или пренебрежительную форму от Миска или Миско.

Основа фамилии, скорее всего, происходит от имени или прозвища Миска. В старину Миска — это не только уменьшительное от Михаил (через народную форму Миша), но и самостоятельное прозвище. В некоторых говорах «миска» означала человека с круглым лицом или того, кто любит поесть. Однако нельзя исключать и тюркские корни: в башкирском и татарском языках есть слово «мискә» — бочка, кадушка. Прозвище Миске мог получить полный или приземистый человек. Суффикс -ек в таком случае смягчил основу, а затем добавился русский родовой суффикс -ов.

Географически фамилия Мискичеков тяготеет к южнорусским регионам и Поволжью, особенно к территориям бывшего Казанского ханства, где смешивались славянские и тюркские антропонимы. Встречается она крайне редко: в современных базах данных — единичные случаи, в основном в Чувашии и Татарстане. Это указывает на то, что фамилия не разошлась широко, а осталась локальной, возможно, в рамках одного рода или нескольких соседних деревень.

Социальный контекст фамилии тоже прозрачен: Мискичековы — почти наверняка крестьяне или однодворцы. Суффикс -еков характерен для фамилий, образованных от прозвищ в простонародной среде, где уменьшительные формы были нормой. Дворянские роды с таким суффиксом практически неизвестны. Таким образом, носитель фамилии Мискичеков может с большой вероятностью считать, что его предок — человек с прозвищем Мискичек (маленький Миска, круглый или бочковатый), живший в XVI–XVII веках на границе русского и тюркского миров.