Фамилия Мискирчян — один из тех случаев, когда географическая привязка оказывается важнее разбора корня. Почти наверняка это армянская фамилия. На это указывает типичный армянский патронимический суффикс «-ян» (в старой орфографии — «-янц»), означающий «принадлежащий к роду» или «потомок кого-то». В русской передаче фамилии оканчиваются на «-ян» или «-янц», и Мискирчян — характерный пример.

Сложнее с основой «Мискирч». Сразу видно, что она не армянского происхождения. Скорее всего, это тюркское или персидское слово, которое вошло в армянский язык. Наиболее правдоподобная версия связывает её с тюркским «мискир» или «мискин» — «бедняк», «нищий». В персидском «мискин» имеет то же значение, а также «смиренный». В таком случае фамилия Мискирчян образована от прозвища Мискирчи — «бедняк» или, возможно, «нищий (дервиш)». Суффикс «-чи» в тюркских языках указывает на профессию или склонность к чему-то, то есть Мискирчи — это человек, который либо был беден, либо вёл аскетичный образ жизни.

Есть и другая, менее вероятная версия: от названия профессии. В некоторых тюркских диалектах «мискир» могло означать медника или лудильщика, но это значение встречается редко и в основном в среднеазиатском регионе. Для армянской диаспоры, особенно западной, более типично первое значение — прозвище по социальному или религиозному признаку.

Таким образом, фамилия Мискирчян — это армянская фамилия, образованная от тюркского или персидского прозвища Мискирчи («бедняк») с помощью патронимического суффикса «-ян». Предок носителя этой фамилии, скорее всего, получил такое прозвище либо из-за бедности, либо из-за принадлежности к аскетической религиозной традиции. Фамилия редкая, и её носители, вероятно, происходят из Западной Армении или регионов, где армяне долго жили в тюркоязычном окружении.