Фамилия Миссипопинская — редкая и нестандартная для русского ономастикона. Её основа, «Миссипопи», звучит как географическое название или прозвище, а суффикс «-инск-» указывает на польско-украинскую или западнорусскую модель образования (типичную для шляхетских, а затем и крестьянских фамилий на -ский/-цкий). Чаще всего такие фамилии означают «выходец из такого-то места» или «принадлежащий к чему-то», поэтому первая версия: предок был родом из села, урочища или владения с названием Миссипопи. Где именно мог находиться такой топоним — вопрос открытый. Возможно, это искажённое польское «Misiopię» или «Misiopiny» (от «miś» — медведь и «piać» — петь, то есть «медвежий распев» — прозвище места), либо след от личного прозвища «Миссипопа» — шутливого или иноязычного.

Вторая, более рискованная гипотеза: фамилия могла возникнуть как случайная канцелярская запись — в XIX веке при переписях крестьянам давали фамилии по названиям ближайших рек, городов или даже по созвучию с иностранными словами. «Миссипопи» — почти «Миссисипи», и не исключено, что священник или писарь, наслушавшись рассказов о далёкой Америке, закрепил такое прозвище за человеком, который чем-то напоминал «американца» (например, носил длинный сюртук или любил рассказывать небылицы). Однако эта версия менее надёжна: обычно подобные «экзотические» фамилии встречаются в среде ссыльных или старообрядцев, но документальных подтверждений для Миссипопинской нет.

Третий вариант — суффикс «-инская» может быть женской формой от мужской фамилии Миссипопинский, но в данном случае, скорее всего, это исходная форма, так как фамилии на -ская/-цкая в женском роде часто сохранялись у незамужних дочерей или вдов в документах. В любом случае, перед нами фамилия-загадка: её корень не вписывается ни в славянские прозвищные модели (типа «Медведев» или «Попов»), ни в типичные топонимические ряды. Если вы носите эту фамилию, стоит поискать в семейных архивах упоминания о переселениях с запада Российской империи (Волынь, Подолье) или о связях с польской шляхтой — именно там такие необычные названия могли возникнуть из местных говоров или диалектов.