Фамилия Мисяутов — редкая, и её происхождение не лежит на поверхности. В основе, скорее всего, лежит нестандартное личное прозвище или имя, образованное от тюркского корня. Разберём слово по частям: корень «Мисяут-» и русский патронимический суффикс «-ов», указывающий на принадлежность («чей?» — сын Мисяута).

Самая вероятная версия связывает основу с тюркским словом «мис» или «миш», которое в разных диалектах означает «медь», «медный», а также «кот» (ср. татарское «мияу» — мяукать, откуда и «мияулы» — кошачий). Прозвище Мисяут могло относиться к человеку с рыжими, «медными» волосами, либо к тому, кто обладал кошачьими повадками — тихим шагом, хитростью или любовью к мурлыканью. Вторая, менее распространённая гипотеза, выводит имя из арабского «Мисяут» как искажённой формы имени Масуд (счастливый), но фонетически это менее убедительно.

Суффикс «-ут» в тюркских языках часто встречается в личных именах и прозвищах (ср. татарские и башкирские имена типа Сайфут, Хабибут, где -ут — уменьшительно-ласкательный или усилительный аффикс). Таким образом, Мисяут — это уменьшительная форма от прозвища на «мис-», закрепившаяся как фамильное имя.

Географически фамилия Мисяутов тяготеет к регионам с сильным тюркским субстратом: Поволжье, Урал, Западная Сибирь. Встречается она в Башкортостане, Татарстане, а также среди казанских и сибирских татар. Русские носители фамилии, скорее всего, потомки крещёных татар или людей, получивших прозвище в полиэтничной среде. Сословно предки могли быть как крестьянами, так и служилыми людьми (казаками, толмачами), поскольку тюркские прозвища нередко давали именно в пограничных зонах.

Интересно, что фамилия сохранила редкое сочетание «яу» в корне, что делает её легко узнаваемой. В отличие от более частых Мисягиных или Мисюревых, Мисяутовы — пример того, как тюркская основа обросла русским окончанием, не потеряв своей звуковой экзотики.