Фамилия Мисютинская — редкий случай, когда географическая привязка оказывается сильнее прозвищной. Почти наверняка перед нами «географическая» фамилия, образованная по модели «владелец усадьбы + -ск(ий)». Основа здесь — топоним Мисютино (или Мисютин), а суффикс -ск- указывает на то, что фамилия изначально принадлежала дворянину или помещику, владевшему этим селом или деревней. В крестьянской среде фамилии на -ский до реформы 1861 года были редкостью, их чаще получали выходцы из духовенства или шляхты.

Сам топоним Мисютино, скорее всего, восходит к прозвищу или некалендарному имени Мисюта. Это уменьшительная форма от более старого имени Мисюра, которое в русских говорах означало «милый», «ласковый» (сравните с диалектным «мисюрик» — неженка). В ономастических словарях (например, у Веселовского) встречается фамилия Мисюрев, а прозвище Мисюра фиксируется в XVI веке. Таким образом, Мисютинская — это «та, что из рода Мисютиных», а сам родоначальник Мисюта был, вероятно, человеком мягкого нрава или просто носил ласкательное прозвище.

Обратите внимание на окончание -ая. Это типичная «женская» форма фамилии, которая закрепилась за женщинами в русской традиции (сравните: Иванов — Иванова, Мисютинский — Мисютинская). В современных документах мужчины с такой фамилией будут писаться как Мисютинский, а женщины — Мисютинская. Встречаются и варианты написания через «е» — Месютинская, что связано с аканьем в произношении.

Географически фамилия тяготеет к центральным и северным областям России: есть деревни Мисютино в Тверской, Ярославской и Костромской областях. Именно оттуда, скорее всего, и пошли дворянские или однодворческие роды Мисютинских. В отличие от фамилий на -ов/-ев или -ин, которые часто возникали стихийно, Мисютинская с её суффиксом -ск- указывает на более осознанное, «книжное» происхождение — её носители в XVII–XVIII веках могли быть мелкими помещиками или священнослужителями, получившими фамилию по названию прихода.