Фамилия Мижайлютин — редкий случай, когда в основе лежит не имя, а прозвище, образованное от глагола. Разберём её по частям. Корень «мижайл-» восходит к диалектному глаголу «мижайлить» — то есть медлить, мешкать, копаться. В некоторых говорах так говорили о человеке нерасторопном, задумчивом или просто любителе тянуть время. Суффикс «-ютин» (а не более привычный «-ин») указывает на принадлежность — буквально «сын или потомок Мижайли». То есть фамилия отвечала на вопрос «чей?»: чей сын? — Мижайлютин.

Такая словообразовательная модель встречается в русских фамилиях реже, чем стандартная на «-ов» или «-ин». Она характерна для северных и северо-западных регионов, особенно для бывших новгородских земель, где прозвищные формы на «-юта» и «-ютин» были в ходу. Сравните: фамилии Терютин (от Терюта — производное от Терентий), Костютин (от Костюта — уменьшительное от Константин), Митютин (от Митюта — форма Дмитрия). Мижайлютин стоит в том же ряду, но основа у него не от крестильного имени, а от прозвища.

Прозвище Мижайля (или Мижайло) могло закрепиться за человеком, который постоянно опаздывал, работал неспешно или, наоборот, был настолько основательным, что его неторопливость бросалась в глаза. В русских говорах слово «мижайлить» фиксируется в значении «медлить, зевать», а сам «мижайла» — это и есть медлительный человек. Таким образом, фамилия напрямую описывает характер или поведение первого носителя.

Встречаемость фамилии невысокая. В современных базах данных Мижайлютины сосредоточены в основном в Вологодской, Архангельской областях и в Пермском крае — то есть в регионах, куда в XVI–XVII веках уходили переселенцы с Русского Севера. Это подтверждает версию о северном происхождении. Варианты написания с буквой «а» (Мижайлютин) или через «о» (Мижойлютин) — скорее всего, результат местного произношения или ошибок переписчиков, но основной корень остаётся тем же.

Итак, предок современных Мижайлютиных получил прозвище за свою медлительность или неторопливый нрав. Фамилия не аристократическая, а крестьянская или посадская, что типично для большинства русских родовых имён, образованных от прозвищ.