Фамилия Мижигурский — одна из тех, где разбор упирается в редкое и неочевидное слово. С первого взгляда видна типичная модель: суффикс -ский указывает на происхождение от географического названия, скорее всего, от топонима с основой Мижигур-.

Самая прямая версия — связь с названием населённого пункта. В польском и украинском ономастиконе встречаются сёла и хутора с корнем Мижи-, который восходит к праславянскому *meždu («между»). Вторая часть — -гур- — это диалектный вариант слова «гора» (от польского góra или украинского гора). То есть Мижигур буквально значит «между гор». Такие названия давали поселениям в лощине или ущелье. Фамилию Мижигурский, следовательно, мог получить либо выходец из такого места, либо помещик, владевший имением с таким именем.

Суффикс -ский в польско-украинской традиции часто носил шляхетский оттенок, но не был исключительной привилегией дворян. Крестьяне тоже получали такую форму, если переселялись из деревни с соответствующим названием. В пользу западнорусского или польского происхождения говорит и само сочетание: в великорусских говорах «межигорский» встречается, но форма «Мижигурский» с ударным -у- характерна для юго-западных диалектов.

Встречается и версия, что основа — личное прозвище Мижигура, то есть человек, живший «между гор». Но для фамилий на -ский прозвищная этимология менее типична: такие фамилии почти всегда топонимические. Поэтому основной путь — от названия местности.

В польских источниках известен вариант Międzygórski (Мендзыгурский) — та же модель, но с более полной огласовкой. Мижигурский — это, скорее всего, его восточнославянская адаптация, где носовой звук упростился. В современной Украине и Беларуси фамилия встречается, но редко; в России — единичные случаи, в основном в западных областях.

Сословная принадлежность первых носителей остаётся неясной: фамилия могла принадлежать как мелкой шляхте, так и крестьянам, перешедшим на новое место. Без конкретных генеалогических записей определить точнее нельзя.