Основой фамилии Мкртчян послужило церковное имя Мкртыч. Фамилия Мкртчян восходит к популярному армянскому мужскому имени Мкртыч, которое в переводе на русский язык означает «креститель». Согласно историческим источникам, царь Трдат, после многих лет преследования последователей Христа, освободил из темницы ревностного проповедника новой веры великомученика Григора (Григория Просветителя). Затем вместе со всей царской семьей и двором принял от него крещение и повелел крестить весь народ, всех жителей страны Армянской, от мала до велика. Господствовавшая до этого на протяжении многих веков, унаследованная от предков древняя языческая вера, поклонение всему множеству богов-идолов, были запрещены, а христианство провозглашено единственно приемлемой и опекаемой государством религией. Произошло это на пятнадцатом году царствования Трдата, то есть в начале IV века. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Мкртыч, со временем получил фамилию Мкртчян.