Фамилия Мнусских — редкий пример отыменного образования по модели, которая почти не встречается за пределами нескольких регионов. В ней сразу бросается в глаза окончание -их, точнее, его вариант -ских. В русской ономастике фамилии на -их и -ских (а также на -ых, -ских) указывают на принадлежность к роду: они отвечают на вопрос «чьи?» и обычно закреплялись за целой семьёй или династией. Такие фамилии характерны для северных и центральных областей России, а также для Сибири, куда их принесли переселенцы из Архангельской, Вологодской и Вятской губерний.

Основа фамилии — Мнус- — не имеет очевидных параллелей в современных славянских языках. Вероятнее всего, это не полное имя, а сокращённая или диалектная форма от какого-либо канонического имени. Можно предположить, что в основе лежит имя Мануил (от древнееврейского «с нами Бог»). В народной речи оно нередко звучало как Мануйло, а в бытовых сокращениях — как Мануша, Мануха или Мнуша. Форма Мнус могла возникнуть как упрощение от Мнуша с заменой суффикса или как самостоятельное прозвище, возможно, связанное с глаголом «мнуть» — так могли назвать человека неловкого, постоянно мнущего одежду, или же, наоборот, работника, занятого разминанием глины, кожи, теста. Однако связь с именем Мануил выглядит более надёжной, поскольку фамилии на -ских чаще образовывались от личных имён, а не от прозвищ по действию.

Склонение фамилии подчиняется правилам для притяжательных прилагательных: Иван Мнусских, Анна Мнусских, говорят о Мнусских. В письменных источниках фамилия почти не встречается — это говорит о её крайней малочисленности и, возможно, узколокальном бытовании, например, в какой-то одной деревне или волости. Носители фамилии, если они сохранились, скорее всего, происходят из одного родового гнезда, и их предки в XVIII–XIX веках могли быть крестьянами или мещанами тех мест, где фамилии на -ских были нормой.