Фамилия Мочекина — женская форма фамилии Мочекин, и её разбор стоит начать с того, что это редкая фамилия с неочевидной, но вполне прозрачной этимологией. В основе лежит прозвище или нецерковное имя Мочека. Такие имена были распространены в русской деревне до XVII века и образовывались с помощью суффикса -ека, который придавал слову уменьшительно-пренебрежительный оттенок (ср. Ванека, Степека). В данном случае корень, скорее всего, — глагол «мочить» или прилагательное «мокрый».

Прозвище Мочека могли дать человеку по разным причинам. Самая прямая версия — его дали тому, кто постоянно оказывался мокрым: рыбаку, бурлаку, работнику на водяной мельнице или просто человеку, который часто попадал под дождь и не успевал просохнуть. В говорах слово «моча» могло означать сырость, слякоть, болотистую местность, поэтому прозвище иногда привязывалось к месту жительства — «живущий у мокрого места». Менее вероятна, но возможна связь с диалектным значением «мочка» (льняной пучок, мочёный лён), тогда Мочека — это прозвище льновода или того, кто занимался вымачиванием льна.

Суффикс -ин в фамилии Мочекин (а значит, и Мочекина) указывает на принадлежность: «чей?» — Мочекин, то есть сын или потомок Мочеки. По модели это типичная патронимическая фамилия, возникшая в среде крестьян и посадских людей. Учитывая, что прозвище Мочека не связано с церковным календарём, фамилия сформировалась в среде, где основой для именования служили бытовые черты или род занятий, а не имя святого.

В дореволюционных источниках фамилия Мочекин и её женская форма Мочекина встречаются нечасто. Это не фамилия дворянского рода (окончание на -ин у дворян редкость, они обычно заканчивались на -ов/-ев или -ский). Скорее всего, предки носительницы фамилии были государственными или помещичьими крестьянами, реже — мещанами. Географически фамилия тяготеет к центральным и северным губерниям России, где было развито льноводство и рыболовство, то есть к регионам с традиционной «мокрой» работой.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями, то Мочекин стоит в одном ряду с Мочаловым, Мочалкиным, Мокроусовым, но отличается от них именно уменьшительным суффиксом -ека, который придаёт прозвищу оттенок чудаковатости или несерьёзности. В отличие от фамилии Мочалов (от «мочало», лыко), Мочекин прямо указывает на действие или состояние — «мокрый человек». Сегодня фамилия Мочекина — редкая, и её носители могут с высокой долей вероятности проследить свои корни до крестьянского сословия, жившего у воды или занимавшегося мокрым ремеслом.