Фамилия Мочиинят — редкий пример субстратной финно-угорской модели, сохранившейся в русском ономастиконе. Её основание — не русское прозвище или крестильное имя, а, скорее всего, искажённое прибалтийско-финское или саамское слово. На слух фамилия звучит как «Мочиинят» с ударением, вероятно, на последний слог, что сразу выдаёт нерусский корень.

Разбор словообразования здесь нестандартный. Суффикс -ят в русских фамилиях обычно указывает на «детёныша» или принадлежность к роду (ср. Козлят, Телят), но в данном случае он, по всей видимости, передаёт финский суффикс множественного числа -t, обозначающий «род, семья». Основа «Мочиин» может восходить к саамскому močč (заяц) или карельскому močči (маленький, короткий). Таким образом, Мочиинят — это «зайчата» или «коротышки», то есть прозвище целого рода по характерному признаку предка.

Географически фамилия почти наверняка привязана к Русскому Северу — Архангельской области, Карелии или Кольскому полуострову. Именно там, в зоне контакта русских с саамами и карелами, возникали подобные гибридные формы, где финский суффикс прирастал к русскому окончанию, а потом всё вместе осмысливалось как фамилия. В метрических книгах XIX века такие фамилии часто записывали на слух, отсюда возможны варианты: Мочиенят, Мочинят, Мочият.

Сословно носители фамилии, скорее всего, были государственными крестьянами или промышленниками (рыбаками, охотниками). Дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано. В современной России Мочиинят встречается единично, в основном в Мурманской области и Архангельске — это реликтовая фамилия, сохранившая память о древнем населении Севера.