Фамилия Могрунов — одна из тех, где корень не бросается в глаза и не лежит на поверхности. На первый взгляд кажется, что она связана с чем-то могучим или могучим, но это обманчивое впечатление. На самом деле основа здесь — старинное русское прозвище или некалендарное имя Могрун. Оно образовано от глагола «могрунить» — в некоторых говорах так говорили про ворчливого, угрюмого или недовольного человека. Соответственно, Могрун — это ворчун, брюзга, человек с тяжелым характером. Суффикс -ов указывает на типичную модель русских фамилий: Могрунов — сын Могруна, потомок того, кого прозвали за угрюмость.

Версия с тюркским следом маловероятна. Слово «могрун» не встречается в тюркских языках в качестве антропонима или бытового термина, а попытки притянуть его к «могол» (монгол) или «могур» (холм) не выдерживают критики: суффикс -ун в русских прозвищах (как в Хрипун, Ворчун) — стандартная словообразовательная модель, а в тюркских фамилиях он не работает.

Географически фамилия редкая. Основной ареал — центральные области России, особенно Поволжье и Вятка. Встречается в старых переписях Казанской и Нижегородской губерний. Это косвенно подтверждает, что Могруновы — потомки крестьян или посадских людей, получивших фамилию по прозвищу предка. Дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано, в родословных книгах она не значится. В советское время фамилия стала встречаться шире за счет миграций, но по-прежнему остается малочисленной.

В написании путаницы почти не бывает: вариант «Магрунов» встречается, но это, скорее всего, ошибка переписчиков или диалектное произношение (аканье). Устойчивое ударение — на второй слог: Могру́нов.