По одной из версий, фамилия Мольдон является исконно эстонской и восходит к слову mold - «кормушка, корыто». Возможно, прозвище Мольдон получил человек, занимавшийся кормлением домашнего скота или птицы. То есть это прозвище относится к числу «профессиональных» именований. Согласно другой гипотезе, Мольдон — это фонетический вариант немецкой фамилии Мольден. Она также образована от прозвища, которое происходит от нижненемецкого слова molde - «деревянная чашка, глубокая тарелка». Следовательно, Мольденом могли называть резчика по дереву, того, кто занимался изготовлением деревянной посуды.