Фамилия Модон — одна из тех, что при поверхностном взгляде кажется иноязычной, но при ближайшем рассмотрении оказывается исконно русской, хотя и редкой. Её основа — не заимствование, а диалектное слово, которое сохранилось в северных и сибирских говорах. «Модон» или «модонь» — так в некоторых областях называли медлительного, неповоротливого человека, увальня. Слово родственно глаголу «модеть» (медлить, мешкать) и существительному «модя» (копуша). Таким образом, прозвище Модон получал человек с флегматичным характером или неспешной походкой.

Фамилия образована по редкой для восточнославянской традиции, но встречающейся на Русском Севере модели — путём перехода прозвища в фамилию без добавления суффикса. Это так называемые «нулевые» фамилии, или фамилии-прозвища в чистом виде. В отличие от массовых Модоновых или Модониных, форма Модон закрепилась напрямую: «Иван, по прозвищу Модон» — «Иван Модон». Такая модель характерна для казачьих областей, Сибири и Поморья, где фамилии часто фиксировали прозвище без изменений.

Географически фамилия тяготеет к востоку. По данным переписей и метрических книг, Модоны встречаются в Забайкалье, в бывших казачьих станицах, и в Якутии. В Якутии фамилия могла получить вторую жизнь: местное слово «модон» переводится как «крепкий», «сильный», «могучий». Поэтому у якутских Модонов возможна иная, тюркская этимология, не связанная с русским «копушей». Спор между версиями решается просто: если предки фамилии — русские старожилы Сибири, то корень севернорусский; если же носители имеют якутские корни, то значение меняется на противоположное — «силач» или «богатырь».

С точки зрения словообразования, фамилия стоит особняком. В ней нет ни отчества (как у Ивановых), ни указания на место (как у Горских). Она целиком состоит из корня, что делает её похожей на древнейший пласт русских прозвищных фамилий, которые не переделывали под общую суффиксальную моду. Сравните: Глухих, Седых, Косых — там суффикс -их/-ых, а Модон стоит в начальной форме. Это редкий случай, когда прозвище «застыло» в именительном падеже.

В словарях русских фамилий Модон не упоминается в основных списках — её нет ни у Унбегауна, ни у Веселовского. Это говорит о том, что фамилия локальная и немногочисленная. Её носители — скорее всего, потомки одного или нескольких родов, расселившихся по сибирскому тракту. Если ваши предки — Модоны, стоит искать их корни в метрических книгах Иркутской губернии или Якутской области: именно там фамилия оставила наиболее заметный след.