Фамилия Момса — редкий случай, когда корень слова не поддаётся однозначной славянской этимологии. В отличие от большинства русских фамилий, образованных от крестильных имён, профессий или внешних признаков, эта фамилия почти наверняка имеет тюркское или кавказское происхождение. Скорее всего, её основа — тюркское слово «момса», которое в некоторых диалектах означает «нежный», «мягкий» или «слабый». В таком случае прозвище Момса могли дать человеку с тихим, покладистым характером, либо, напротив, иронично — здоровяку или задире.

Модель образования фамилии проста: она не получила типичного русского суффикса -ов/-ев или -ин, а застыла в форме чистого прозвища. Это характерно для фамилий, которые возникли в среде, где русский язык был не единственным, — например, у донских казаков, татарских мурз или народов Северного Кавказа. Окончание -а указывает на то, что слово могло быть адаптировано как существительное женского рода, но в качестве фамилии оно склоняется по общему правилу (Момса, Момсы, Момсе). Встречаются также варианты написания «Мамса» или «Момсов», но исходная форма без суффикса — самая редкая и архаичная.

Географически фамилия Момса встречается крайне редко. Основные очаги — Ростовская область, Ставрополье и Краснодарский край, а также некоторые районы Казахстана, куда её могли принести переселенцы. В дореволюционных переписях она практически не фиксируется, что указывает на её позднее закрепление или на малочисленность рода. В словарях русских фамилий (например, у Б. Унбегауна) она отсутствует, что подтверждает её нерусские корни.

Есть и альтернативная версия, менее вероятная, но любопытная: в некоторых говорах «момса» могло быть искажением слова «момз» или «момза», означающего «копун», «медлительный человек». Однако эта гипотеза не находит серьёзной лингвистической поддержки, так как подобные формы не зафиксированы в диалектных словарях. Таким образом, наиболее правдоподобным остаётся тюркское происхождение с исходным значением «мягкий, нежный», а носители фамилии — потомки людей, получивших такое прозвище за характер или внешность.