Фамилия Морачковская — женская форма польской или западнорусской фамилии Морачковский, и её разбор стоит начать с суффикса, который многое говорит о происхождении носителей. Окончание -ский/-цкий указывает на дворянское или шляхетское происхождение в Речи Посполитой, а также на географическую привязку: такую фамилию обычно получали по названию имения или местечка. В основе лежит топоним Морачково или Морачка — таких названий несколько в Беларуси и Польше. Например, деревня Морачково (Moraczkowo) есть в Великопольском воеводстве, а село Морач (Moracz) — на юго-востоке Польши. Выходец из такого места становился «Морачковским» — то есть «тем, кто из Морачкова».

Корень фамилии — «Морач» (Moracz) — скорее всего, происходит от личного имени или прозвища. В польской ономастике «Moracz» могло быть производным от слова «morzyć» (морить, изнурять) — так в средневековье могли прозвать человека с суровым характером или того, кто занимался морильным делом (например, красильщик, использующий едкие составы). Менее вероятна, но возможна связь с чешским «morák» (индюк) — в польских говорах так могли дразнить заносчивого человека. В любом случае, фамилия не связана с русским «морачить» (обманывать) — это позднее просторечное слово, не зафиксированное в старых источниках.

Интересная деталь: написание через «ч» (Морачковская) — характерно для белорусской и украинской передачи, где польское «cz» читается как твёрдое «ч». В польском оригинале фамилия звучала бы как Moraczkowska, с мягким «ч». В Российской империи после разделов Польши такие фамилии часто русифицировали, заменяя окончание -ский на -ской, но форма «Морачковская» сохранила исходный шляхетский суффикс. Сословно носители этой фамилии в XIX веке принадлежали к мелкой шляхте или однодворцам — обедневшим дворянам, жившим на границе сословий. Встречается фамилия в основном в западных областях: Брестская, Гродненская области Беларуси, а также в Волынской области Украины.

Сравните с однокоренными: Морачевский (от того же корня, но с суффиксом -евский) и Морач (без суффикса — более редкая, часто крестьянская форма). Морачковская стоит в ряду «географических» фамилий, которые несут прямую подсказку: предок был владельцем или жителем имения Морачково. Если вы носите эту фамилию, стоит поискать в метрических книгах XIX века по Гродненской или Минской губернии — там вероятность найти прямых предков наиболее высока.