Фамилия Моркиляс резко выделяется на фоне типичных русских фамилий. В ней нет привычных суффиксов -ов, -ин или -ский. Окончание -ас указывает на литовское или, шире, балтийское происхождение. В литовском языке суффикс -as — это стандартное окончание мужских фамилий в именительном падеже (например, Будрайтис, Садаускас). Так что перед нами не переделанная на русский лад фамилия, а сохранившая исходную балтийскую форму.

Основа «Моркил-» с большой вероятностью восходит к литовскому слову «morkyla» или близким диалектным формам. Это слово означает «морковь». Соответственно, прозвище Моркиляс могли дать человеку, который выращивал морковь, торговал ею или, возможно, имел рыжий цвет волос, напоминающий цвет корнеплода. В литовской антропонимике прозвища от названий овощей и растений встречаются, хотя и не так часто, как прозвища от ремесел или внешних черт.

Вторая, менее вероятная, но допустимая версия связывает фамилию с литовским «markėti» — «мерцать», «мелькать». В этом случае Моркиляс могло быть прозвищем подвижного, верткого человека. Однако лингвистически связь с «морковью» выглядит прямее и проще: корень «mork-» хорошо прослеживается в балтийских языках, а суффикс -yl- часто образует названия растений или предметов.

По географии фамилия тяготеет к западным регионам современной Беларуси, юго-востоку Литвы и востоку Польши — территориям, где веками смешивались литовские, польские и восточнославянские языки. В России Моркиляс — фамилия редкая, её носители, скорее всего, потомки выходцев из этих земель, переселившихся в XIX–XX веках.

Социально фамилия не указывает на дворянское происхождение. Она из крестьянской или мещанской среды, где прозвища давали по занятию или заметной особенности. Никаких громких исторических личностей с такой фамилией в открытых источниках не значится, что только подтверждает её «народный» и локальный характер.