Фамилия Моркина образована от мужской формы Моркин и относится к самому распространённому типу русских фамилий — с суффиксом -ин. В этой модели основой почти всегда служит имя или прозвище, оканчивающееся на -а/-я: Морка — уменьшительное от канонического имени Морк, Морко, Морква. Но здесь скрывается неожиданный поворот: имя Морк в святцах отсутствует, зато есть редкое Морква (греческого происхождения, от μάρκος — молот). В народе такие имена переосмысливали и сокращали до Морка, так что первый вариант — от имени Морква.

Вторая версия, более бытовая и прозрачная, — от прозвища Морка, которое давали человеку, связанному с морковью. В русских говорах «морква» — это морковь, а «морка» могло означать либо корнеплод, либо, в переносном смысле, рыжеватого человека (по цвету моркови). Такие прозвища по растениям и овощам встречаются нередко: Репка, Капустин, Огурцов. Правдоподобность версии подкрепляется тем, что фамилии с корнем «морк-» (Морков, Морковкин) фиксируются в переписных книгах XVII века, особенно в северных и центральных уездах России.

Географически фамилия Моркина сегодня встречается в основном в Поволжье и на Урале, что косвенно указывает на более позднее закрепление — в зонах переселенческого движения. В дореволюционных списках она редка, что говорит о её сравнительно позднем оформлении (вторая половина XIX века) или о локальном бытовании. Социальный срез: носители фамилии — преимущественно крестьяне и мещане, без привязки к дворянским родам.

Обратите внимание на орфографический момент: фамилия Моркина пишется через «о», а не через «а» (Маркина — другая фамилия, от имени Марк). Ударение, судя по говорам, чаще падает на первый слог: Мо́ркина. Встречается и вариант Мо́ркин (мужской), но женская форма Моркина — самостоятельная и не обязательно указывает на замужнюю женщину: в русской традиции такую фамилию могла носить и незамужняя девушка.