Фамилия Морушкина образована от имени собственного и относится к распространенному типу славянских фамилий. Основой послужило мирское имя Морушка, которое берет начало от глагола «морить», то есть «томить, утомлять, мучить». Скорее всего, это охранительное именование: нарекая младенца Морушкой, родные надеялись, что он вырастет здоровым и крепким, а злое имя, по поверьям, отпугнет болезни и беды.

Но есть и другая версия. Не исключено, что Морушка — прозвище, восходящее к тому же глаголу «морить», но в значении «безмерно смешить». В русских говорах «морить» могло означать и «насмешить до упаду», поэтому прозвище Морушка вполне могло отражать характер весельчака и балагура. Обе трактовки правдоподобны, но охранительная выглядит убедительнее: такие имена давали детям повсеместно, а прозвищная версия опирается на более узкое диалектное значение.

Фамилия построена по простой и понятной модели: к основе Морушк- добавлен суффикс -ин, который в русском языке указывает на принадлежность. Морушкин — это «сын Морушки», «ребенок того, кого звали Морушкой». Такая модель типична для северных и центральных русских земель, где имена на -ка активно переходили в фамилии.

Стоит обратить внимание и на саму форму Морушка. Это уменьшительно-ласкательный вариант, который мог стоять за целым рядом крестильных имен: Мор — сокращение от Мордвин или Мороз, а иногда так звали человека с «морщинистым» лицом. Впрочем, связь с глаголом «морить» остается основной.

Представители фамилии встречаются в документах. В Книге памяти Республики Татарстан упомянут Александр Семенович Морушкин, родившийся в 1882 году в селе Каймары Высокогорского района. Эта запись показывает, что фамилия бытовала в Поволжье, где русские фамилии нередко соседствовали с местными традициями именования.