Фамилия Морушкин образована от имени собственного и относится к распространенному типу славянских фамилий. Основой фамилии послужило мирское имя Морушка, которое берет начало от глагола «морить», то есть «томить, утомлять, мучить». Скорее всего, имя Морушка относится к охранительным именованиям: нарекая младенца Морушкой, родные хотели, чтобы он рос здоровым и крепким, обманывая тем самым злых духов, которые, по поверьям, не позарятся на «заморенного» ребенка.

Впрочем, есть и другая версия. Не исключено, что фамилия Морушка образована от аналогичного прозвища, восходящего к тому же глаголу «морить», но со значением «безмерно смешить». В этом случае именование Морушка отражает особенности характера его обладателя — весельчака и балагура, который мог «уморить» со смеху. Обе трактовки правдоподобны, но первая, охранительная, выглядит убедительнее: имена-обереги были широко распространены в дохристианской традиции и долго сохранялись в быту.

Сама форма фамилии — с суффиксом -ин — указывает на принадлежность: Морушкин означает «сын Морушки». Такая модель типична для северных и центральных русских земель, где имена на -ка (Морушка, Ивашка, Петрушка) охотно превращались в фамилии.

В Книге памяти Республики Татарстан упоминается Александр Семенович Морушкин, родившийся в 1882 году в селе Каймары Высокогорского района. Эта запись — редкое документальное подтверждение бытования фамилии в Поволжье. О точном месте и времени возникновения фамилии говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был длительным и шел в разных регионах неравномерно. Тем не менее, фамилия Морушкин — замечательный памятник славянской письменности и культуры, сохранивший в себе отголосок древних народных верований.