Фамилия Мошошин — один из тех случаев, когда написание подсказывает путь к разгадке. Суффикс -ин указывает на происхождение от основы на -а или -я, то есть от прозвища или имени, которое заканчивалось на «а». В этом ряду — Мошока, Мошко, Моша. Но есть и вторая, более редкая версия: фамилия могла образоваться от слова «мошош» — в диалектах русского севера так называли медлительного, нерасторопного человека или, наоборот, того, кто «мошонится», то есть мешкает, копается. В говорах Вологодчины и Архангельской области слово «мошошка» фиксировалось как прозвище для неуклюжего или вялого человека.

Если же отталкиваться от более распространённой модели, основа Мошош — это вариант крестильного имени Моисей в его народной, просторечной форме. В русских говорах имя Моисей «обкатывалось» до Мосей, Мось, Мося, Моша, а от Моши через суффикс -ок- получалось Мошок, далее — Мошош (с характерным для северных говоров «оканьем» и переходом «к» в «ш» перед гласным). Так что Мошошин — это буквально «сын Мошока» или «человек из рода Мошока», где Мошок — уменьшительное от Моисей. Подобная цепочка (Моисей → Мося → Мошок → Мошош) встречается в ономастике, хотя и не так часто, как прямые формы вроде Моисеев или Мосеев.

Географически фамилия тяготеет к северо-востоку европейской России: переписи XIX века фиксируют Мошошиных в Вятской и Пермской губерниях, реже — в Костромской. Это косвенно подтверждает и диалектную версию, и модель с крестильным именем, так как именно в этих краях хорошо сохранялись архаичные формы имён. Встречаемость фамилии невысока — это редкая патронимическая фамилия, не попавшая в массовые списки дворянства или купечества; её носители, скорее всего, были государственными или удельными крестьянами.

Есть и третий, менее вероятный вариант: связь с диалектным «мошна» (кошель, мешок для денег). Но тогда фамилия звучала бы как Мошнин или Мошонкин, а не Мошошин — суффикс -ош- здесь нехарактерен для прозвищ, связанных с предметами. Поэтому версия с именем или с глагольным корнем «мошош» выглядит убедительнее. В любом случае, Мошошин — фамилия, которая хранит следы живой народной речи, где имя или прозвище прошло несколько ступеней упрощения, прежде чем закрепиться в документах.