Фамилия Моякунов — редкая, и её происхождение не лежит на поверхности. Чтобы понять её, нужно разобрать не столько корень, сколько модель образования и возможную географию бытования.

Скорее всего, фамилия имеет тюркские корни. Основа «Моякун» может восходить к тюркскому личному имени или прозвищу. В тюркских языках, особенно в казахском, киргизском, башкирском и татарском, «моя» или «мойа» может означать «шея» (от «мойын»), а «кун» — «день» или «солнце». Однако прямое сложение этих значений («шея-день») маловероятно. Более правдоподобна версия, что «Моякун» — это искажённая или диалектная форма имени Маякун, где «мая» — «обезьяна» (в переносном смысле — прозвище ловкого, подвижного человека), а «кун» — уменьшительно-ласкательный аффикс. В таком случае фамилия могла означать «сын того, кого звали Маякун» — то есть человека с прозвищем «обезьянка».

Суффикс «-ов» указывает на русскую патронимическую модель, характерную для фамилий, возникших в среде, где русский язык был официальным, а носители — выходцы из тюркоязычных народов. Это типично для Поволжья, Урала или Сибири, где татары, башкиры или казахи получали фамилии по отцу с русским окончанием. Если бы фамилия осталась в родной среде, она звучала бы как Моякун, без суффикса.

Есть и менее вероятная, но лингвистически возможная версия: связь с монгольским «моя» — «металл» или «железо» (ср. монг. «моё»). Тогда Моякун могло быть прозвищем кузнеца или человека, работавшего с металлом. Однако в русском ономастиконе такая основа встречается редко, и фамилия почти не фиксируется в источниках.

Что касается сословной принадлежности, определённо сказать ничего нельзя. Фамилия не дворянская и не купеческая — она не встречается в родословных книгах. Скорее всего, предки Моякуновых были крестьянами или казаками, возможно, переселенцами с южных или восточных окраин Российской империи. Географически фамилия тяготеет к регионам с тюркским населением: Башкортостан, Татарстан, Оренбургская область. Встречается она крайне редко, что делает её уникальной даже среди редких фамилий.

Итак, главный вывод: фамилия Моякунов — это русифицированная форма тюркского отчества от прозвища или имени Моякун, скорее всего, означавшего «ловкий, как обезьянка» или (реже) «железный человек». Носители фамилии — потомки тюркоязычных предков, живших в смешанной русско-тюркской среде.