Фамилия Мозерис — один из тех случаев, когда форма говорит о происхождении больше, чем корень. Окончание -ис выдает в ней фамилию литовского или, шире, балтийского происхождения. В русском языке такое окончание нетипично для исконных фамилий, но встречается в фамилиях, пришедших из Литвы, Латвии или с белорусско-литовского пограничья. Если бы фамилия была русской, она скорее звучала бы как Мозеров или Мозерин.

Основа Мозер- восходит, скорее всего, к литовскому слову mozėti или mozė — «мазать», «пачкать», либо к mozuras — «грязнуля», «неряха». В таком случае прозвище Мозерис могли дать человеку неопрятному, или, наоборот, тому, кто работал с глиной, краской, сажей — например, маляру или печнику. Есть и менее вероятная версия: от mozė в значении «малыш», «карапуз», но для взрослого прозвища это звучит неправдоподобно.

Встречается фамилия в основном в Литве и среди литовцев, а также в тех регионах бывшей Российской империи, куда переселялись литовцы после отмены крепостного права. В России она редка и почти всегда указывает на литовские корни предка. Иногда написание путают с латышскими фамилиями на -ис, но в латышском языке ударение обычно на первый слог, а в литовском — на последний: Мозери́с.

С точки зрения словообразования, это типичная литовская фамилия с суффиксом -is, который указывает на лицо по характерному признаку или действию. Встречаются однокоренные варианты: Мозерас, Мозерис, Мозерунас — они различаются суффиксами, типичными для разных диалектов литовского языка.