Фамилия Мозокина — женская форма фамилии Мозокин, и её происхождение напрямую связано с мужским прозвищем или именем Мозок. В основе лежит слово «мозг», но не в прямом анатомическом смысле, а в переносном, прозвищном. В русских говорах «мозок» могли называть человека умного, сообразительного, либо, наоборот, с иронией — того, кто «мозгует», то есть много размышляет, но медленно действует. Встречается и другая версия: в некоторых диалектах «мозок» означало «костный мозг» или даже «сало», что могло относиться к упитанному человеку. Выбрать одну из гипотез сложно, но первая, интеллектуальная, выглядит более распространённой для прозвищ такого типа.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: Мозокин — сын или потомок Мозока. Это типичная модель русских фамилий, образованных от прозвищ, оканчивающихся на согласный. Фамилия Мозокина встречается редко, что говорит о её локальном происхождении — скорее всего, из северных или центральных областей России, где прозвищные фамилии дольше сохранялись в крестьянской среде. В документах XVII–XVIII веков можно найти упоминания крестьян и посадских людей с корнем Мозок- в Вологодской и Архангельской губерниях.

Интересно, что фамилия Мозокин не связана с украинским или белорусским «мозок» в значении «мозг» — там это слово звучит как «мозок», но ударение падает иначе, и фамилии от него образовывались бы через -ович или -енко. Русский вариант с суффиксом -ин чётко указывает на великорусскую среду. В современном написании фамилия закрепилась без удвоения согласных, хотя в старых записях можно встретить вариант «Мозоккин» с двумя «к» — это следы диалектного произношения.

О социальном статусе первых носителей сказать сложно, но, судя по модели, это были крестьяне или ремесленники, получившие прозвище за характерную черту — ум, медлительность или внешность. Фамилия не дворянская и не купеческая, её редкая встречаемость делает её ценной для генеалогического поиска: каждый носитель, скорее всего, связан с небольшим родовым гнездом.