Фамилия Мсоева — одна из тех, что сразу приковывает внимание необычным сочетанием звуков. В ней нет привычного славянского суффикса -ов или -ин, и это подсказывает главное: корни фамилии лежат на Кавказе, скорее всего, в осетинской или ингушской среде. Основа «Мсо» восходит к мужскому личному имени Мсо, которое, в свою очередь, связано с осетинским словом «мæсыг» — «башня» или «крепость». В горах Кавказа башни были не просто жильём, а родовыми символами, убежищами и знаками силы. Имя Мсо могло означать «крепкий, как башня», «надёжный», «защитник».

Фамилия образована по осетинской модели с суффиксом -ев/-ев, который указывает на принадлежность к роду: Мсоев — буквально «из рода Мсо», «сын Мсо». Окончание -а в женском варианте Мсоева — это грамматический маркер рода, типичный для русской передачи осетинских фамилий.

Географически фамилия Мсоева встречается в Северной Осетии, особенно в Дигорском ущелье, и у ингушей. В ингушском языке есть имя Масо, и фамилия могла записываться как Масоев, но со временем под влиянием осетинского произношения закрепилась форма Мсоев. Спор между этими версиями решается просто: обе правдоподобны, но осетинская опирается на прямое значение слова «башня» и на частотность в осетинской ономастике.

Исторически предки Мсоевых были, скорее всего, горцами-воинами или скотоводами. Фамилия не относится к древним княжеским родам, но и не крестьянская в привычном русском смысле — в осетинском обществе каждый род имел свою фамильную башню и земельный надел. Мсоевы могли владеть башней в одном из ущелий, что и закрепилось в их родовом имени.

Встречается и вариант написания Мсаева — с буквой «а» вместо «о», но это скорее опечатка или адаптация под иные кавказские языки. В русских документах фамилия фиксируется с конца XIX века, когда осетины массово получали паспорта и записывались по отцу.