Фамилия Мучицын — редкая и неочевидная с первого взгляда. Если отбросить случайные ассоциации с мукой или мучениями, её основа — уменьшительно-ласкательное имя или прозвище Мучица. В русской ономастике суффикс -иц- часто образовывал краткие формы от крестильных имён (например, Федя → Федица, Вася → Васица). В данном случае в основе лежит имя Матвей (в просторечии — Матюха, Матя, Матуся), от которого через форму Матуца или Матица могло появиться Мучица. Фонетическая замена «а» на «у» (аканье, диалектное произношение) и упрощение «т» → «ч» — обычное дело в живой речи.

Модель образования проста: от личного имени Мучица притяжательный суффикс -ин дал фамилию Мучицын, то есть «сын Мучицы». Такие фамилии характерны для северных и центральных губерний России, где -ин был основным патронимическим суффиксом, вытесняя -ов у имён на мягкий согласный.

Версия о связи с профессией (мучник, мельник) маловероятна: в русских говорах слово «мучица» не фиксируется как обозначение ремесла, а уменьшительное от «мука» (мучица) — слишком редкое и не дало бы фамилии с суффиксом -ин. Куда реальнее, что предок носителя фамилии Мучицын звался в быту Мучицей — так в деревне могли ласково окликать Матвея или, реже, Митрофана (от Митроха → Митрица → Мучица). Фамилия осталась в узком кругу носителей, не получив массового распространения, и сегодня встречается эпизодически, в основном в центральных областях России.