Фамилия Мудищева — женская форма от Мудищев, и с этимологической точки зрения это один из тех случаев, когда современное звучание обманчиво. Основу фамилии составляет слово «муди» — древнерусское название мужских половых органов. Вопреки ожиданиям, в старину это была не ругань, а анатомический термин, вполне употребительный в бытовой речи и даже в лечебниках. От него образовалось прозвище Муда или Мудило, которое давали не для оскорбления, а по характерной черте — либо физиологической, либо поведенческой (например, болтливый или задиристый человек).

Сам суффикс -ищев указывает на принадлежность к роду: Мудищев — буквально «сын Мудища». Форма Мудищев встречается реже, чем ожидалось бы от столь ходового корня, что говорит о её локальном происхождении. Скорее всего, фамилия закрепилась в северных или центральных областях России, где прозвища на -ище были особенно распространены. В документах XVII–XVIII веков подобные фамилии фиксировались у крестьян и посадских людей — духовенство и дворянство такие основы избегало.

Вторая, менее вероятная версия связывает фамилию с диалектным глаголом «мудить» — медлить, мешкать. В этом случае прозвище Мудище мог получить нерасторопный или ленивый человек. Однако основное значение корня в русской ономастике перевешивает: большинство исследователей (в том числе Б. Унбегаун в «Русских фамилиях») относят подобные фамилии к группе «телесных» прозвищ, которые в народной среде не несли табуированного смысла.

Таким образом, предки современной носительницы фамилии Мудищева — скорее всего, крестьяне или ремесленники, получившие родовое имя по прозвищу, которое сегодня кажется грубым, но триста лет назад было обычным бытовым словом. Фамилия редкая, в современных справочниках почти не встречается, что подтверждает её узколокальное бытование.