Фамилия Мудраченко — яркий пример украинской модели фамилий на -енко. Суффикс -енко (в старых формах -енк(о), -енко) в XVI–XVII веках был основным способом обозначения потомка по отцу: Мудраченко буквально значило «сын Мудрака» или «маленький Мудрак». Такие фамилии массово закрепились в Поднепровье, Слобожанщине и на юге России, куда уходили переселенцы.

Основа — Мудрак. Это не имя, а прозвище, образованное от прилагательного «мудрый» с помощью суффикса -ак. В украинской и южнорусской традиции суффикс -ак часто придавал слову оттенок носителя признака, иногда с лёгкой иронией или просто как характеристика человека. Мудрак — это «мудрец», человек, которого в округе считали рассудительным, опытным или хитрым. В отличие от фамилии Мудров (от той же основы, но с русским суффиксом -ов), Мудраченко сохраняет украинскую словообразовательную цепочку: Мудрак → Мудраченко.

Встречается и вторая, менее вероятная, версия: прозвище Мудрак могли дать не за ум, а по внешнему сходству — в некоторых говорах «мудраком» называли рыбу (например, усача или голавля). Но для фамилии такая версия слаба: прозвища по рыбам обычно давали рыбакам или по внешности (например, Ершов, Карасев), а Мудрак для этого слишком редок. Куда надёжнее объяснение через личное качество.

Географически фамилия Мудраченко чаще всего встречается в Центральной Украине (Черкасская, Полтавская, Киевская области) и в приграничных регионах России (Белгородская, Курская, Воронежская области). В XIX веке носители фамилии были в основном крестьянами и казаками — в реестрах Войска Запорожского встречаются прозвища Мудрый и Мудрак, от которых и пошла фамилия.

Интересная деталь: в отличие от фамилий на -енко от имён (Петренко, Иващенко), Мудраченко образована от прозвища, что говорит о том, что предок был заметной фигурой в общине — его не просто звали по отцу, а выделяли по уму. Фамилия не дворянская, не книжная, а народная, живая — она прямо указывает на характер человека, который её основал.