Фамилия Муфтафутдинов — одна из тех, что на слух кажется длинной и сложной, но на деле складывается по прозрачной и логичной модели. Её основа — арабское мужское имя Муфтафутдин, что в переводе означает «избранный (или предпочтённый) верой» или «отборный служитель религии». Как и многие фамилии на -ов, она образована от отчества: «чей сын?» — Муфтафутдинов, то есть потомок человека по имени Муфтафутдин. Модель типична для тюрко-татарской среды, где арабские имена с религиозным значением были особенно популярны среди мусульманского духовенства и образованных слоёв.

Само имя Муфтафутдин составное: первая часть «муфтафа» (араб. مفضل, «избранный», «предпочтённый») — тот же корень, что и в слове «муфтий» (знаток шариата, дающий разъяснения). Вторая часть — «уддин» (араб. الدين, «вера», «религия»). Таким образом, имя буквально означает «тот, кого предпочла вера» или «избранный для веры». Встречаются варианты написания: Муфтафутдинов, реже — Муфтафетдинов, что связано с особенностями произношения в разных диалектах татарского и башкирского языков.

Фамилия распространена в Татарстане, Башкортостане, а также среди татарской диаспоры в других регионах России. Встречается и в среде казанских татар, и у мишарей. Социальный контекст её появления — скорее всего, среда мусульманских священнослужителей (мулл, мударрисов) или грамотных горожан, которые в XIX — начале XX века первыми получали фамилии по отцу. В крестьянской среде фамилии часто давались по имени деда, но здесь мы видим именно отчество от имени с ярко выраженным религиозным оттенком, что указывает на определённый статус предка.

Интересная деталь: суффикс -ов здесь не русский, а адаптированный под русскую грамматику тюркский патронимический формант. В татарском языке отчество строилось бы как «Муфтафутдин улы» (сын Муфтафутдина), но при оформлении документов в Российской империи его заменили на стандартное -ов. Это типичный случай, когда фамилия сохраняет звучание имени, а не прозвища, и сразу говорит о вере и происхождении её носителя.