Фамилия Муголимова — одна из тех, где форма на -ов/-ева не должна вводить в заблуждение: её основа не славянского, а тюркского происхождения. Если отбросить типичный русский суффикс принадлежности -ов, получим корень «Муголим». В нём угадывается имя или прозвище, связанное с монгольским миром: «могол» (вариант «мугул») в тюркских языках означало «монгол», а в Средней Азии так называли представителей династии Великих Моголов. Суффикс -им мог быть частью арабского имени (например, Му‘аллим — «учитель», «наставник») или местным тюркским окончанием, превращающим этноним в личное имя.

Скорее всего, в основе фамилии лежит прозвище Муголим — «монгол» или «человек из племени моголов». В Поволжье и Приуралье, где фамилия встречается чаще всего (особенно у татар и башкир), такое прозвище могло указывать на внешность, род занятий (контакты с кочевниками) или даже на легендарного предка, которого считали выходцем из монгольских степей. Менее вероятна, но возможна версия от арабского «му‘аллим»: если носитель был грамотным человеком, учителем при мечети, прозвище могло закрепиться за ним и его потомками.

Женская форма Муголимова образована по стандартной русской модели: к основе мужской фамилии Муголимов добавили окончание -а. Сама мужская фамилия сформировалась в XIX — начале XX века, когда у тюркских народов начали массово фиксировать фамилии по русскому образцу. Примечательно, что фамилия не получила широкого распространения за пределами Волго-Уральского региона, что делает её локальным маркером: если вы встретили Муголимову, велика вероятность, что её корни ведут в татарские или башкирские деревни.