Фамилия Мухамадеев отвечает на вопрос «чей?» и образована по классической русской модели от личного имени Мухамадей — одной из народных форм арабского имени Мухаммад. В переводе с арабского оно означает «прославляемый», «достойный хвалы». Так звали пророка, поэтому имя веками оставалось одним из самых распространённых у мусульманских народов, а его производные дали начало множеству фамилий у татар, башкир и народов Кавказа.

Суффикс -ев в данном случае присоединился к основе, оканчивающейся на мягкий согласный (й), и указывает на принадлежность: Мухамадеев буквально значит «сын Мухамадея». Форма Мухамадей — это результат естественного для тюркских языков смягчения и упрощения долгого арабского имени: конечный «ад» перешёл в «ай», как это случилось, например, с именами Габдуллай или Хусаин. Такая адаптация делала имя удобным для повседневного произношения в татаро-башкирской среде.

Интересно, что в официальных документах XIX века, когда у мусульман Поволжья и Приуралья начали массово фиксировать фамилии, одну и ту же семью могли записать по-разному: Мухамадеев, Мухаметдинов или Мухамадуллин. Переписчики не всегда улавливали разницу между отчеством и фамилией, поэтому за основу брали то имя отца, то имя деда. В итоге Мухамадеевы — это, как правило, потомки человека, которого в быту звали именно Мухамадей, а не полным именем Мухаммад.

Географически фамилия гуще всего встречается в Татарстане, Башкортостане и в Челябинской области, куда в XVIII–XIX веках переселялись татары и башкиры для работы на уральских заводах. Там фамилия закрепилась в формах Мухамадеев и Мухамадеева, а в дореволюционных метрических книгах нередко писалась через «г» — Мухамадеевъ, что отражало старое произношение с гортанным звуком.

В отличие от многих фамилий, которые со временем теряют связь с исходным именем, Мухамадеев сохраняет прямую отсылку к имени пророка. Это делает её не просто родовым знаком, но и напоминанием о религиозной традиции предков. Носитель фамилии может с уверенностью сказать, что его родословная восходит к человеку, носившему одно из самых почитаемых имён в исламе.