Фамилия Мухаметшины образована от восточного мужского имени Мухаммад, точнее — от его разговорной тюркской формы Мухаметша. Имя Мухаммад в переводе означает «прославляемый», «восхваляемый». Так что в основе фамилии лежит не прозвище и не ремесло, а личное имя родоначальника, которое носили в честь пророка.

Словообразовательная модель здесь простая и прозрачная: к основе Мухаметш- добавили русский патронимический суффикс -ин, который указывает на принадлежность: Мухаметшин буквально значит «сын Мухаметши». Это типичный способ оформления тюркских имен в русской среде, когда восточное имя отца становилось основой для фамилии потомков.

Историю происхождения таких фамилий обычно связывают с выходцами из Золотой Орды — печенегами, половцами или более поздними тюркскими народами. Корни фамилии Мухаметшин уходят в XV–XVII века, когда тюркские имена активно проникали в русскую антропонимию. Этому способствовал и тот факт, что многие дворянские роды России имели нерусское происхождение: их предки переходили на службу к московским князьям, принимали крещение, но сохраняли память о родовом имени.

Стоит оговориться: сам по себе факт образования фамилии от мусульманского имени не означает, что все Мухаметшины — потомки ордынской знати. В Поволжье и на Урале, где веками жили татары и башкиры, такие фамилии были массовыми. После присоединения Казанского ханства в XVI веке многие татарские роды постепенно интегрировались в русское общество, и их имена переоформлялись по русским моделям. Поэтому для части носителей фамилия могла закрепиться ещё в то время, а для других — сформироваться позже, в XVIII–XIX веках, при переписях и паспортизации.

В написании фамилии встречается вариант Мухаметшин (с одной «с») и реже — Мухамметшин (с удвоенной). Оба варианта отражают разное произношение исходного имени. В татарской среде имя чаще звучало как Мөхәммәт, отсюда и основа Мухаметш-. В русских документах закрепился именно этот вариант, без удвоения.

Несмотря на внешне восточное звучание, фамилия Мухаметшин давно стала частью русской ономастики — её носили и носят люди разных национальностей, и в этом смысле она такой же памятник культурного взаимодействия, как, скажем, фамилии Юсуповы или Аксаковы, тоже восходящие к тюркским именам.