Фамилия Мухаярова образована от имени Мухаяр — краткой, производной формы старинного составного имени Мухамметьяр. Это имя сложилось из двух частей. Первая восходит к арабскому имени Мухаммет, что значит «восхваляемый, прославляемый». Вторая часть — персидское существительное «яр», то есть «близкий друг», «помощник», «товарищ». Складываясь, эти части дают трактовку «товарищ Мухаммета» — именование, которое звучало как пожелание дружбы и поддержки со стороны почитаемого пророка.

Такие двусоставные имена с корнем «яр» были распространены в среде татар, башкир и других тюркских народов, где ощущалось сильное персидское культурное влияние. Имена вроде Мухамметяр, Насибулляр или Габдулляр часто усекались в быту до более коротких форм, и Мухаяр — как раз такой случай. От этого обиходного варианта и пошла фамилия.

Модель образования здесь классическая для русской и тюрко-русской традиции: к основе Мухаяр добавили патронимический суффикс -ов, а для женской линии — окончание -а. Форма Мухаярова указывает на то, что её носительница — потомок человека по имени Мухаяр. Мужской вариант фамилии — Мухаяров.

Стоит заметить, что фамилия эта редкая. Она не встречается в старинных боярских или дворянских списках, что говорит о её сравнительно позднем оформлении. Массово фамилии у татар и башкир закреплялись в XIX — начале XX века, когда после реформ учёта населения возникла необходимость фиксировать родовые прозвания. До этого момента человека чаще называли по имени отца: Мухаяр улы, то есть «сын Мухаяра».

Географически фамилия тяготеет к регионам Поволжья и Урала — территориям расселения татар и башкир. Встречается она и у казахов, где имя Мухаяр также бытовало в несколько иной фонетической огласовке.

Само имя Мухамметьяр в истории не было редкостью. Подобные имена давали в честь уважаемых религиозных деятелей, а частица «яр» добавляла оттенок близости и дружеской привязанности. Поэтому человек по имени Мухаяр воспринимался как «помощник» или «близкий друг» в общине, и это значение закрепилось за его потомками уже в виде фамилии.

Таким образом, фамилия Мухаярова хранит память о мусульманской традиции именослова, о персидском влиянии на тюркскую культуру и о том, как длинные многосоставные имена сжимались в повседневной речи до коротких и удобных форм.