Фамилия Мухаяров — одна из тех фамилий, где история рода спрятана в самом звучании, и чтобы её услышать, нужно разобрать имя по частям. В основе лежит мужское имя Мухаяр — не самостоятельное, а сокращённая, обиходная форма более полного имени Мухамметьяр. Такое «усечение» длинного имени — обычное дело в тюркской среде, где громоздкое составное имя в быту часто стягивали до короткого и удобного.

Имя Мухамметьяр, в свою очередь, — типичный пример восточного двухосновного имени. Первая часть восходит к арабскому имени Мухаммет, что значит «восхваляемый, прославляемый» — это одно из ключевых имён исламского мира. Вторая часть — персидское существительное «яр», которое переводится как «близкий друг», «помощник», «товарищ». Соединившись, части дают красивую смысловую конструкцию: «товарищ Мухаммета» или «друг Мухаммета». То есть имя изначально не просто называло человека, а словно бы определяло его духовную близость к пророку, ставило его в отношение к сакральному имени.

Фамилия же Мухаяров образовалась по классической для русской ономастики модели: к основе Мухаяр добавили типичный русский патронимический суффикс -ов. Так, потомок человека по имени Мухаяр, отвечая на вопрос «чей ты?», получал прозвание Мухаяров — «сын Мухаяра». Со временем это прозвание закрепилось как наследственная фамилия. Важно заметить, что суффикс -ов здесь не меняет восточную природу имени, а лишь адаптирует его к русской грамматике, что типично для фамилий народов Поволжья и Приуралья, где татары и башкиры веками жили в тесном соседстве с русскими.

В написании фамилии встречается вариант с одной «а» в середине — Мухаяров, что отражает редукцию гласной в безударной позиции. Сама фамилия довольно редкая и несёт явный отпечаток татаро-башкирской или казахской среды, где имена с компонентом «яр» были широко распространены. Встречаются и родственные фамилии, образованные от того же полного имени: Мухаметьяров, Мухаммадьяров — все они указывают на одного и того же предка, носившего составное имя, но выжившего в памяти потомков в разных формах.