Фамилия Мухутдинова — классическая русская фамилия, образованная от личного имени Мухутдин. Это диалектный вариант имени Мухамметдин, которое состоит из двух арабских корней: «Мухаммед» переводится как «прославляемый», а «Дин» — как «вера». Сложив части, получаем значение «прославляющий веру». Имя Мухаммед носил пророк ислама, центральная фигура этой религии, поэтому имя и производные от него фамилии широко распространены у народов, исповедующих ислам.

Принадлежность к женскому роду указывает суффикс -а, а сама модель образования — притяжательный суффикс -ов, который добавлялся к основе имени отца. Первоначально Мухутдинова означала «дочь или жена человека по имени Мухутдин», то есть указывала на прямую родственную связь. Такой способ формирования фамилий был типичен для русской ономастической традиции, где отчество или дедичество закреплялось за потомками и передавалось дальше.

Интересно, что форма Мухутдинова — это не единственный вариант, порождённый этим именем. Встречаются однокоренные фамилии Мухутдинов, Мухаметдинов, Мухамметдинов. Разница в написании объясняется диалектным произношением: в устной речи звук «а» в первом слоге редуцировался, и имя звучало как «Мухутдин». Когда писарь фиксировал услышанное, он записывал именно тот вариант, который бытовал в конкретной местности. Поэтому по фамилии можно предположить регион проживания предков: форма с «у» чаще встречается у татар и башкир, тогда как вариант с «а» ближе к литературному арабскому произношению.

Процесс формирования фамилий у мусульманских народов Поволжья и Урала был длительным и завершился в основном к концу XIX — началу XX века, когда переписи населения и административные реформы потребовали закрепить фамилии за каждым родом. До этого момента человек мог называться по имени отца, деда или по прозвищу, и лишь позднее это прозвище становилось наследственным. Окончательно говорить о точном месте и времени возникновения конкретного рода Мухутдиновых можно только на основании генеалогических исследований, архивных метрических книг и ревизских сказок. Но сам факт, что фамилия сохранила архаичную диалектную форму имени, говорит о глубоких корнях и устойчивости семейной традиции.