Фамилия Мухутдинова образована от имени Мухутдин. Оно является одним из диалектных вариантов имени Мухамметдин, которое состоит из двух компонентов: Мухаммед в переводе с арабского означает «прославляемый», а Дин - «вера». Таким образом, имя Мухутдин можно перевести как «прославляющий веру» Имя Мухаммед носил арабский проповедник единобожия и пророк ислама, центральная фигура этой религии. Процесс формирования фамилий был достаточно длительным, поэтому окончательно говорить о точном месте и времени возникновения рода Мухутдиновых можно лишь на основании генеалогических исследований.